Ngày 6/3/2007, theo Quyết định số 290/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ, Trường Đại học Kinh tế thuộc ĐHQGHN được thành lập trên cơ sở Khoa Kinh tế thuộc ĐHQGHN. Và theo Quyết định của Ban Thường vụ Đoàn ĐHQGHN, Đoàn TNCS Hồ Chí Minh Khoa Kinh tế - ĐHQGHN được đổi tên thành Đoàn TNCS Hồ Chí Minh Trường Đại học Kinh tế - ĐHQGHN từ tháng 4/2007.
Từ khi trở thành cơ sở Đoàn trực thuộc ĐHQGHN (1999) đến nay, Đoàn Trường Đại học Kinh tế đã trải qua 5 nhiệm kỳ hoạt động, nhiệm kỳ 2017-2019 là nhiệm kỳ thứ 7.
II. BAN CHẤP HÀNH
| Bí thư: Nguyễn Trung Phong ĐT: (84-24) 37547506 + 701 Email: phongnt@vnu.edu.vn |  |
| Phó Bí thư: Trần Thị Thu Hưởng ĐT: (84-4) 39956897 Email: huong_ttt@vnu.edu.vn |  |
| Phó Bí thư: Nguyễn Thị Thanh Mai ĐT: (84) 975.701.257 Email: maintt@vnu.edu.vn |  |
BCH Đoàn Thanh niên Trường ĐH Kinh tế nhiệm kỳ 2017 - 2019, gồm:
| TT | Họ và tên | Chức vụ |
| 1 | Nguyễn Trung Phong | Bí thư Đoàn trường |
| 2 | Trần Thị Thu Hưởng | Phó Bí thư Đoàn trường |
| 3 | Nguyễn Thị Thanh Mai | Phó Bí thư Đoàn trường |
| 4 | Nguyễn Viết Dũng | Ủy viên Ban Thường vụ |
| 5 | Lê Thị Liên | Ủy viên Ban Thường vụ |
| 6 | Cao Thành Long | Ủy viên |
| 7 | Phạm Ánh Hồng | Ủy viên |
| 8 | Hoàng Thị Linh | Ủy viên |
| 9 | Nguyễn Thị Ngọc Mai | Ủy viên |
| 10 | Hà Thị Vân Anh | Ủy viên |
| 11 | Trần Quốc Hoàn | Ủy viên |
| 12 | Tô Việt Anh | Ủy viên |
| 13 | Lê Hồng Tuấn | Ủy viên |
| 14 | Vũ Thị Thu Hà | Ủy viên |
| 15 | Ngô Thị Thanh Bình | Ủy viên |
| 16 | Đỗ Thu Phương | Ủy viên |
| 17 | Nguyễn Tố Vân | Ủy viên |
III. CHỨC NĂNG, NHIỆM VỤ
- Đại diện, chăm lo và bảo vệ lợi ích chính đáng của đoàn viên, sinh viên.
- Giáo dục lý tưởng, truyền thống đạo đức, lối sống và ý thức pháp luật cho đoàn viên.
- Phối hợp với Hội sinh viên tổ chức các chương trình hỗ trợ học tập, nghiên cứu khoa học, các khóa học huấn luyện kỹ năng, các chương trình văn hóa thể thao nhằm giúp sinh viên nâng cao kiến thức và hoàn thiện nhân cách sinh viên.
- Phối hợp với chính quyền, các đoàn thể và các tổ chức kinh tế, xã hội làm tốt công tác thanh niên, chăm lo xây dựng Đoàn, tích cực xây dựng cơ sở Đoàn, Hội, Đội ở địa bàn dân cư, tham gia xây dựng, bảo vệ Đảng và chính quyền.